[ホーム>家系分析>家系分析実例]
*** 計算例 ***
家系分析の例を自殖,他殖作物別に示す.
自殖作物
水稲トップ 15品種 (平成 19年産収穫量順位) の家系の特徴.
---- | ------------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------- |
順位 | 品種名 | 育成年 | 主産地 | 祖先数 | 除共通 | 世代数 | 対コシ | 愛国 | 旭,朝日 | 亀の尾 | 農林1号 | 農林22号 |
---- | ------------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------- |
1 | コシヒカリ | 1956 | 新潟 | 12 | 11 | 3 | 1 | 0.250 | 0.125 | 0.125 | 0.531 | 0.531 |
2 | ひとめぼれ | 1992 | 宮城 | 162 | 51 | 12 | 0.796 | 0.215 | 0.116 | 0.109 | 0.417 | 0.473 |
3 | ヒノヒカリ | 1989 | 熊本 | 226 | 70 | 12 | 0.608 | 0.184 | 0.130 | 0.078 | 0.292 | 0.455 |
4 | あきたこまち | 1984 | 秋田 | 136 | 64 | 11 | 0.615 | 0.286 | 0.237 | 0.070 | 0.308 | 0.454 |
5 | はえぬき | 1992 | 山形 | 360 | 84 | 12 | 0.535 | 0.245 | 0.237 | 0.109 | 0.307 | 0.411 |
6 | キヌヒカリ | 1988 | 兵庫 | 130 | 53 | 12 | 0.534 | 0.152 | 0.099 | 0.090 | 0.348 | 0.309 |
7 | きらら397 | 1987 | 北海道 | 220 | 71 | 11 | 0.244 | 0.173 | 0.035 | 0.071 | 0.263 | 0.107 |
8 | つがるロマン | 1997 | 青森 | 472 | 96 | 14 | 0.412 | 0.201 | 0.217 | 0.105 | 0.243 | 0.347 |
9 | ななつぼし | 2001 | 北海道 | 908 | 114 | 15 | 0.350 | 0.239 | 0.043 | 0.100 | 0.291 | 0.189 |
10 | ほしのゆめ | 2000 | 北海道 | 560 | 117 | 13 | 0.300 | 0.193 | 0.077 | 0.063 | 0.249 | 0.176 |
11 | まっしぐら | 2005 | 青森 | 776 | 126 | 14 | 0.492 | 0.190 | 0.184 | 0.116 | 0.296 | 0.352 |
12 | あさひの夢 | 1999 | 栃木 | 944 | 96 | 15 | 0.393 | 0.192 | 0.231 | 0.045 | 0.171 | 0.395 |
13 | あいちのかおり | 1987 | 愛知 | 156 | 54 | 12 | 0.390 | 0.215 | 0.304 | 0.047 | 0.183 | 0.363 |
14 | 夢つくし | 1994 | 福岡 | 144 | 54 | 13 | 0.767 | 0.201 | 0.112 | 0.107 | 0.439 | 0.420 |
15 | こしいぶき | 2003 | 新潟 | 690 | 102 | 14 | 0.625 | 0.199 | 0.151 | 0.110 | 0.353 | 0.429 |
---- | ------------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------- |
| | | 東平均 | 475 | 86 | 13 | 0.541 | 0.221 | 0.204 | 0.093 | 0.290 | 0.405 |
| | | 西平均 | 164 | 58 | 12 | 0.575 | 0.188 | 0.161 | 0.081 | 0.315 | 0.387 |
| | | 北海道 | 563 | 101 | 13 | 0.298 | 0.202 | 0.052 | 0.078 | 0.267 | 0.157 |
| | | 総平均 | 393 | 78 | 12 | 0.537 | 0.209 | 0.153 | 0.090 | 0.313 | 0.361 |
---- | ------------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------- |
祖先数; 家系図中の祖先総数,除共通;共 通品種除いた数,世代数; 家系図端までの世代数,
対コシ; 対コシヒカリ の近縁係数,その右も対記載品種との近縁係数.
東; 2,4,5,8,11,12, 西; 3,6,13,14, 北; 7,9,10 とした.
昔言われた (山本 1986.こめの履歴書.家の光協会) “東の亀の尾,農林 1 号,西の旭,農林 22 号”の傾向は判然としない. 北海道もじわじわと対コシ値があがっている.
15 品種相互間の近縁係数値
※ (
エクセル) でクラスタ分析 (青木繁伸氏のHp,http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/index.html,を利用) すると産地別に分類された (
図を).
※ ; これはスタンドアロンで計算. 計算時間約 30分 (Let's Note R3 使用).
なお,H12 産全国 top20 品種と祖先品種の近縁係数 (その % 値を寄与率とする) を栽培面積の重み付けで平均すると,愛国 0.209,旭 (朝日) 0.148,大場 (森田早生) 0.155,器量好 (撰一) 0.114,上州 0.106,亀の尾 0.086 となり,累積すると上位 3 品種で 51%,6 品種で 82 %寄与している. コシヒカリ は全国の 1/3 の面積を占めるが,近縁度を考慮すると (ひとめぼれ の 79.6%,ヒノヒカリ の 60.8% …,はコシが植えられているのと同じとする),2/3 がコシの遺伝的背景といえる (
文献).
また,食味とコシ近縁度に相関あり (
文献),なし (
文献),ある場合とない場合(
文献).
他殖,栄養繁殖作物
交配計画の策定のために近交係数を予め計算する. 値が一定以上になったものは避ける. 例; イチゴ カンショ
以上